在整体器官或组织层面进行蛋白质组学研究能够获取复杂的生物功能信息。然而,组织通常由位于不同解剖区域、且具有显著异质性的大量细胞类型组成。传统的蛋白质组学分析方法不可避免地产生平均化效果,并且伴随大量空间信息的丢失。随着单细胞组学技术的迅猛发展,研究人员如今可以在单细胞层面研究遗传学、转录组学、表观遗传学和蛋白质组学。然而,单细胞技术在获取这些信息的同时,往往需要将细胞从其原生环境中剥离,从而牺牲了重要的空间信息,导致我们在解析组织异质性方面面临挑战。
正因如此,空间组学应运而生,能够精确识别不同区域的位置,并解析组织细胞的复杂行为。2022年,空间多组学被《Nature》杂志评选为最值得关注的七项技术之一。空间转录组学技术使我们能够在基因表达层面揭示不同组织和细胞的基因表达差异。然而,转录与蛋白质之间的相关性通常较低,而蛋白质作为细胞功能的执行者,其在靶组织内的空间分布异质性在蛋白质相关的药物治疗中相当常见。因此,准确量化这种空间不均匀分布至关重要,能够帮助揭示治疗成功与否的机制,并为直接治疗和工程干预提供理论支持。因此,实施单细胞或单细胞核分辨率的空间蛋白质组学分析尤为重要。
最近,空间蛋白质组学被《Nature Methods》评选为2024年度技术,彰显了其在揭示生物复杂性、推进精准医学和癌症研究中的革命性作用。环亚集团·AG88推出的FAXP™单细胞和亚细胞器分辨率空间蛋白质组学解决方案,结合了基于水凝胶的组织膨胀技术、滤膜辅助的样本准备流程以及高分辨率的质谱分析,研究者因此能够在组织层面进行单细胞及亚细胞器分辨率的空间蛋白质表达分析。
福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织是病理组织存储和分析的黄金标准,全球有数以亿计的FFPE组织样本存储在生物样本库中。因此,增强对FFPE样本的检测能力将大大扩展空间组学在临床问题中的应用范围。FAXP™为适用于临床FFPE样本的空间蛋白质组学分析提供了一套稳健的工作流程。其自动化样品处理过程提升了145倍的体积分辨率,分析速度提升了约1倍,蛋白质鉴定数量增加了255%。
在产品设计方面,FAXP™采用了雨滴链技术,在DDA和DIA模式下的内酶解效率显著优于传统胶内酶解,特别是在特定小体积组织样本中表现尤为突出。该技术能够有效处理体积小至0.042nL的样本,并达到73µm的横向分辨率,让我们更便捷地实现对单细胞与亚细胞器的空间蛋白组学分析。
通过引入更高效、精细的样本处理流程,FAXP™相较于其他技术整体处理时间节省了53%。此外,FAXP™的FFPE样本单细胞分辨率空间蛋白质组学将为未来的临床研究与应用开辟新的道路。
在结直肠癌患者的研究中,利用FAXP™可以对不同疾病进展阶段的组织进行比较分析,为揭示结直肠癌组织内的异质性提供有效的工具。通过组别间的热图评估,可以表明不同时期、不同患者的蛋白鉴定结果具备一致性,进一步验证了FAXP工作流程的可靠性。
总之,环亚集团·AG88的FAXP™技术在高分辨率空间蛋白组学分析中展现出广泛的应用前景,为研究人员提供了强有力的支持。
如果您对我们推出的FAXP™科研服务及商业化试剂盒感兴趣,欢迎随时与我们联系,环亚集团·AG88期待与您在生物医疗领域共同探索,取得新的突破!